Фамилия Исачкина образована от мужского крестильного имени Исаак, которое в переводе с древнееврейского означает «смеющийся». Согласно библейскому сюжету, имя выбрали не случайно: Сарра, жена Авраама, рассмеялась, услышав пророчество о рождении сына в глубокой старости. В обиходе полное имя Исаак часто сокращали, и в русской народной традиции появилась уменьшительная форма Исачок. Именно она и легла в основу фамилии.

Суффикс -ин в фамилии Исачкина указывает на принадлежность: «чей?» — Исачкин, то есть сын или потомок Исачка. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Фамилия Исачкина — женская форма, а мужская выглядит как Исачкин.

Скорее всего, основатель рода Исачкиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды: фамилии на -ин в этой среде были особенно распространены, поскольку они прямо отвечали на вопрос «чей ты будешь?» и не требовали сложного оформления. Потомок человека по имени Исачок со временем и закрепил за собой фамилию Исачкин.

Стоит отметить, что фамилия достаточно редкая. Её географическое распространение неравномерно: чаще всего она встречается в центральных и южных регионах России, где имя Исаак было более употребительным среди православного населения. В отличие от фамилий на -ов/-ев (например, Исаков), форма Исачкин сохранила в себе живую разговорную основу, что делает её ценной с точки зрения истории русского быта и народной ономастики.