Фамилия Исакджанов — редкая и составная, её разбор сразу даёт ключ к происхождению. Она образована по восточной, скорее всего, тюрко-персидской модели сложения двух основ, где вторая часть — «джан» (от персидского جان — «душа», «жизнь»). В тюркских и иранских языках «джан» — распространённый ласкательный или уважительный компонент, который присоединяли к имени, чтобы подчеркнуть близость или почтение («дорогой, как душа»). Первая часть — Исак — это один из вариантов произношения библейского имени Исаак (в исламской традиции — пророк Исхак, Исак). Таким образом, Исакджан — это сложное личное имя, которое примерно переводится как «дорогой Исак» или «Исак-душа».

Русский суффикс -ов, добавленный в конце, — классический способ русификации таких имён. Он показывает, что носители фамилии — выходцы из Средней Азии или Закавказья (скорее всего, из Узбекистана, Таджикистана, Азербайджана или среди тюркских народов Кавказа), которые оказались в составе Российской империи или СССР. Фамилию дали по отцу: Исакджанов — «сын Исакджана». В паспортной системе XX века такие имена фиксировали именно с русским окончанием, отсюда и привычная форма.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на простые имена (Исаков, Исааков), Исакджанов сохраняет внутреннюю форму уменьшительно-ласкательного обращения. Это говорит о том, что предок, носивший имя Исакджан, вероятно, был младшим или любимым сыном в семье, либо так его называли в знак уважения. По сословной принадлежности — это, скорее всего, не аристократическая, а народная фамилия, распространённая среди оседлого или полукочевого населения, где имя Исак было привычным. Географически фамилия встречается в основном в России среди потомков выходцев из Средней Азии, а также в самом регионе, но уже в местных формах (без -ов).