Фамилия Исаньков — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или арабская, но оформлена она по классической русской модели. Разберём её по частям: корень «Исан» и суффикс «-ьков».

Корень «Исан» — это фонетический вариант имени «Хасан» (от араб. «красивый, хороший»), широко распространённого у народов, исповедующих ислам: татар, башкир, народов Кавказа. В русской среде, особенно в пограничных с татарскими землями регионах, звук «х» часто опускался или заменялся на «и», поэтому «Исан» — обычное бытовое сокращение. Другая версия, менее вероятная, возводит основу к тюркскому слову «исан» (здоровый, невредимый) — такое прозвище могли дать человеку, пережившему тяжёлую болезнь или войну.

Суффикс «-ьков» — редкий вариант притяжательного суффикса «-ов», который появляется в фамилиях, образованных от имён или прозвищ, оканчивающихся на мягкий согласный или «-й». Стандартный «-ов» здесь превратился бы в «Исанов», но форма «Исаньков» указывает на то, что в основе лежала форма «Исанька» — уменьшительно-ласкательное от «Исан». То есть предка звали не просто Исан, а Исанька, и его сын стал Исаньковым.

Географически фамилия тяготеет к зоне русско-татарского пограничья: Поволжье, Урал, южные области России (Рязанская, Тамбовская губернии). В дворянских родословных книгах Исаньковы не числятся — это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где русские и тюркские имена смешивались естественным образом.

Итог: Исаньковы — потомки человека по имени Исанька (уменьшительное от Хасан), жившего скорее всего в XVI–XVII веках в одном из регионов, где православные крестьяне соседствовали с татарами. Фамилия не редкая, но узко локальная.