Фамилия Ишакбаев ведет свое начало от мужского имени Ишакбай, которое имеет сложную структуру и состоит из трех компонентов тюркского происхождения. Первый из них – «иш» –переводится на русский язык как «четный, парный, многочисленный». Поэтому в составе имен компонент «иш» приобретал значение «пара, прибавление, добавка», т.е. Второй компонент – «ак» – переводится на русский язык как «белый, чистый, непогрешимый». Имена, содержащие эту основу, как правило давались как завет – идти по жизни чистым и праведным путем. Элемент «бай» — как «богатый, зажиточный человек; хозяин, господин».