Фамилия Ишаков образована от прозвища Ишак. Это слово было заимствовано из тюркских языков, где ишаком называли осла, мула. Изначально слово «ишак» закрепилось в оренбургских и симбирских говорах, а затем пришло и в остальные говоры русского языка. Вероятно, прозвище Ишак мог получить погонщик ослов, мулов или же очень упрямый человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ишак, со временем получил фамилию Ишаков. Так, в Книге памяти Республики Карелия записаны Ишаков Василий Павлович, который родился в 1894 году (Карелия, Петровский р-н, Линдозеро), и Ишаков Петр Павлович, рожденный в 1900 году там же. А в Книге памяти Московской области отмечен Ишаков Роман Кириллович, который родился в 1888 году (Средне-Волжский край, Челно-Вершинский р-н, ст. Афонькино).