Фамилия Ишанков — одна из тех, где основа говорит о многом, но не сразу. В её центре лежит слово «ишан» — духовный титул у мусульман Средней Азии, особенно распространённый среди суфийских наставников, проповедников и глав религиозных общин. Ишаном называли человека, обладавшего авторитетом в вопросах веры, нередко потомка пророка или основателя суфийского ордена. Соответственно, прозвище Ишан мог получить либо сам носитель такого статуса, либо, что вероятнее, его сын или ученик — в быту прозвища часто переходили на детей по роду занятий отца.

Суффикс -ов в фамилии указывает на русскую модель образования — «чей?» — то есть Ишанков буквально означает «сын Ишана» или «принадлежащий Ишану». Это стандартный патроним, который в XIX–XX веках закрепился у многих народов Российской империи, принимавших православие или попадавших в русскую административную среду. Появление фамилии Ишанков, скорее всего, связано с татарами, башкирами или другими тюркоязычными группами Поволжья и Урала, где титул «ишан» был хорошо известен, а суффикс -ов стал нормой при оформлении фамилий.

Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречаются также варианты Ишанов, Ишаншин, но Ишанков — именно с суффиксом, указывающим на отчество, а не на прямую принадлежность к роду (как -ин). В дореволюционных метрических книгах и переписях фамилия фиксировалась у крестьян и мещан, реже — у купцов, что говорит о её демократичном происхождении: духовный титул не гарантировал богатства, но давал уважение в общине.

Есть и другая, менее вероятная версия: основа могла быть не титулом, а личным именем Ишан — производным от арабского «ишан» (чувство, ощущение) или тюркского «иш» (товарищ). Но в контексте русской фамильной системы именно религиозный оттенок выглядит убедительнее: имя Ишан как самостоятельное встречается редко, а прозвище по должности — часто. Так что Ишанковы — это потомки тех, кого в деревне или городе знали как «ишана», человека с особым духовным весом.