Фамилия Ишанов — одна из тех, что прямо указывает на социальный статус или род занятий предка. В её основе лежит мужское тюркское имя Ишан, которое само по себе было не просто именем, а почётным титулом.

Слово «ишан» в исламской среде у мусульманских народов обозначало суфийского наставника, крупного религиозного деятеля, знатока религиозных дисциплин или просто человека, известного своим благочестием. То есть, это было обращение к уважаемому учителю и наставнику. Со временем этот титул закрепился как личное имя, а от него уже образовалась фамилия по стандартной русской модели с суффиксом -ов, означающим принадлежность: Ишанов — «сын Ишана» или «потомок Ишана».

Касательно точного происхождения самого слова «ишан» среди исследователей нет единого мнения. Татарский учёный Ш. Марджани возводил его к тюркскому «ышан» — «верь», что связывает имя с доверием и верой. Другой видный ономатолог, А. Гафуров, придерживался персидской версии: в персидском языке «ишан» означает «они» — форма вежливого обращения к одному лицу, что тоже хорошо вписывается в логику почтительного титула. Обе версии по-своему логичны, но вторая (персидская) лучше объясняет, почему слово стало обозначать высокий религиозный сан, а не просто абстрактное понятие.

Фамилия Ишанов распространена среди многих тюркских народов: татар, башкир, узбеков, казахов. Это типичная патронимическая фамилия, которая не говорит о дворянском происхождении, а скорее указывает на то, что предок носителя фамилии был духовным лицом или просто глубоко верующим человеком, которого в окружении величали Ишаном.