Фамилия Ишаничева — женская форма фамилии Ишаничев, и её ключ к разгадке лежит не в очевидном корне, а в редком и выразительном суффиксе. Если отбросить окончание, основа «Ишанич» сразу выдаёт способ образования: это так называемая «полуотчество» — форма, указывающая на прямого предка по отцу. Модель «Ишаничев» → «сын Ишанича» → «внук Ишана» — типичный пример восточнославянской антропонимии, но с одной особенностью: суффикс «-ич» здесь присоединён не к полному крестильному имени, а к прозвищу или тюркскому имени.

Самая правдоподобная версия возводит основу к мужскому личному имени Ишан. В тюркских языках (особенно в татарском, башкирском, казахском) «ишан» означало духовного наставника, главу суфийской общины, реже — просто уважаемого, святого человека. Это слово пришло из персидского «īšān» («они», в почтительном смысле — «его преподобие»). Однако, в отличие от фамилий вроде Ишанов или Ишанин, здесь мы видим не просто «принадлежащий Ишану», а цепочку из двух поколений: Ишан → Ишанич (его сын) → Ишаничев (внук). Такая модель указывает, что носитель фамилии — потомок человека, которого звали Ишаничем, то есть сыном Ишана.

Альтернативное объяснение, хотя и менее вероятное, связывает основу с диалектным русским словом «ишанить» (суетиться, хлопотать) или «ишак» (осёл, в переносном значении — упрямый работяга). Но суффикс «-ич» для прозвищ по характеру нехарактерен: обычно от них образовывали фамилии с «-ов» (Ишаков, Ишанов). Форма на «-ич» — маркер отчества, а не прямого прозвища. Поэтому версия с тюркским именем Ишан выглядит убедительнее: она объясняет и редкий суффикс, и географию фамилии.

Фамилия Ишаничева — редкая. Её очаги бытования, судя по открытым данным, тяготеют к Поволжью и Уралу — регионам, где веками соседствовали русские, татары и башкиры. В такой среде тюркское имя Ишан легко входило в обиход, давая начало отчеству Ишанич, а затем и фамилии. Социально предки носителей фамилии скорее всего были крестьянами или посадскими людьми, в среде которых имена-прозвища по отцу закрепились как наследственные в XV–XVII веках. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано.