Фамилия Ишанджанов — одна из тех, что сразу указывает на географический и культурный источник: Средняя Азия, а точнее — узбекская или таджикская среда. Она образована по русской патронимической модели (суффикс -ов), которая в XIX–XX веках массово накладывалась на местные имена при переходе к фамилиям. Без этого суффикса исходная форма — Ишанджан — представляет собой сложное составное имя.

Разбираем имя-основу. Первая часть, «Ишан» (или «Эшон»), в тюркских и персидских языках означает духовного наставника, главу суфийской общины, иногда — просто уважаемого старца. Это слово восходит к персидскому «они» (почтительное множественное число), то есть буквально — «те, к кому обращаются с почтением». Вторая часть, «джан», — классический персидский компонент, означающий «душа», «жизнь», «дорогой». В составе имени он выполняет функцию ласкательного или уважительного обращения: «душа моя», «дорогой». Таким образом, имя Ишанджан можно перевести как «драгоценный, как душа, наставник» или просто «дорогой ишан».

Вероятнее всего, предок носителя фамилии был либо прямым потомком человека с таким именем, либо получил его в качестве почтительного прозвища. Распространение фамилии связано с регионами, где сильны традиции исламского духовенства и суфизма — прежде всего, с Узбекистаном (особенно Хорезм, Бухара, Самарканд) и Таджикистаном. Встречается она и среди этнических узбеков и таджиков, живущих в других странах бывшего СССР.

По социальному происхождению носители фамилии чаще всего не относились к высшей аристократии, но могли принадлежать к духовному сословию — потомственным ишанам, которые нередко владели землями и пользовались большим авторитетом. В советское время фамилия утратила сословную привязку и стала просто родовым именем.

В русском языке фамилия склоняется по мужскому роду (Ишанджанов, Ишанджанова, Ишанджанову), женская форма — Ишанджанова — не склоняется. В написании возможны варианты: через «Э» (Эшанджанов) или с одной «н» (Ишанджанов), но наиболее частотным в документах закрепился именно вариант с «И» и двумя «н».