Фамилия Ищеко — довольно редкая и географически компактная, что сразу наводит на мысль о её региональном происхождении. Носители этой фамилии в основном встречаются на западе Украины, в частности в Ровненской и Волынской областях, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. Такая привязка даёт ключ к разгадке: фамилия, скорее всего, украинская или белорусская, а её основа связана с местным говором.

В центре фамилии — корень «ищ-». В украинском и белорусском языках есть слово «ище» (укр. «ще», «іще»), которое означает «ещё», «снова», «опять». Однако прозвище Ище или Ищеко вряд ли дали человеку за любовь к повторениям. Правдоподобнее, что это усечённая форма от личного имени или прозвища, образованного от глагола «искать» (укр. «шукати», но в некоторых диалектах — «іскати»). В таком случае Ищеко могло означать «искатель», «тот, кто постоянно что-то ищет» — либо по характеру, либо по роду занятий (например, следопыт, разведчик, сборщик податей).

Суффикс «-ко» — один из самых распространённых в украинской ономастике. Он выполняет две функции: уменьшительно-ласкательную (как в именах Стецько, Петько) и указание на принадлежность к роду. В фамилиях типа Ищеко суффикс закрепился в значении «сын Ища» или «потомок человека по прозвищу Ищ(а)». То есть изначально это было отчество или семейное прозвище, которое позже стало наследственной фамилией.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с литовским или ятвяжским субстратом на Волыни. Корень «iš-» в литовском означает «из», а слово «iščioti» — «высматривать». Однако для такой гипотезы нет надёжных подтверждений, и проще объяснить фамилию через славянскую лексику.

Сословная принадлежность Ищеко не прослеживается: фамилия встречается и среди крестьян, и среди казаков. В метрических книгах XIX века она фиксируется в основном в сёлах Ровенщины, что говорит о её народном, а не шляхетском происхождении. В отличие от фамилий на «-ский», которые часто носили дворяне, Ищеко осталась в среде простых людей.