Фамилия Ишимцев восходит к слову Ишим. Скорее всего, она образована от географического названия Ишим. Так называется протекающая в России и Казахстане река, левый приток Иртыша и расположенный на берегу этой реки город в Тюменской области. Очевидно, что основатель рода Ишимцевых некогда жил близ Ишима, за что и получил прозвище Ишимец. Само название Ишим, скорее всего, происходит от мордовского корня «виш» («малая») с помощью суффикса «-им» (-овка) и, таким образом, переводится как Маловка. В татарской языковой среде мягкий начальный звук «в» со временем был утрачен как чуждый нормам татарской речи. Так название Вишим адаптировалось под распространенное тюркское мужское имя Ишим. Действительно, нельзя исключать возможность происхождения фамилии Ишимцев от имени Ишим. Это имя возникло в результате соединения тюркских имён: Иш – «дело, работа» и Мухаммед – «восхваляемый, прославляемый». Ишимом звали одного из ханов казахской орды, жившего XVI-XVII веках. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Ишимец, со временем получил фамилию Ишимцев.