Фамилия Ишуков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Ишуков послужило церковное имя Иоанн. Имя Ишук представляет собой производную форму имени Иоанн. Оно в переводе с древнееврейского языка означает «Божия благодать, Божья милость». Не исключено, что фамилия Ишуков восходит к имени Ишук, которое является производной формой имени Ишкай. Оно образованно путем присоединения к татарсокму существительному «иш» со значением «ровня, товарищ, друг» уменьшительно-ласкательного аффикса -кай. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ишук, со временем получил фамилию Ишуков. О точном месте и времени возникновения фамилии Ишуков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ишуков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.