Фамилия Исмуратов — одна из тех, где ключ к разгадке лежит не в славянском, а в тюркском имени. Её основа — мужское личное имя Исмурат, которое представляет собой стяжённую форму от Исмагил (или Исмагул) и Мурат. Если разобрать это имя по частям, то «Ис-» восходит к арабскому «исм» — имя, а «Мурат» (араб. Мурад) означает «желанный», «цель», «стремление». Таким образом, Исмурат — это «имя желания» или «желанное имя», что было типичной формулой для имён, которые давали долгожданному, вымоленному ребёнку.

Словообразовательная модель фамилии проста и прозрачна: к тюркскому имени Исмурат добавили русский патронимический суффикс -ов. Такая модель была стандартной для крещёных татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья, чьи имена при переходе в православие или при записи в метрические книги русифицировали. Фамилия означает «сын Исмурата» и указывает на прямого предка по мужской линии, носившего это имя.

Географически фамилия Исмуратов наиболее плотно представлена в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане. Это неудивительно: именно здесь исторически жили башкиры и татары, у которых имя Исмурат (в вариантах Исморат, Исмогъот) было в ходу. Встречается фамилия и среди казахов, но там она чаще оформляется без русского суффикса — просто Исмуратов или Исмурат.

Стоит отметить, что в некоторых диалектах имя могло звучать как Исмурат, где первая часть — «ис» (след, знак) или даже «эс» (память, сознание). Однако для ономастики более убедительной выглядит версия с арабским «исм», так как она вписывается в обширный пласт имён с компонентом «исм» (Исмаил, Исмагил, Исхак). В любом случае, социальный статус первых носителей был, скорее всего, крестьянским или военно-служилым (башкирские казаки, тептяри), поскольку фамилии на -ов у тюркских народов закрепились в основном в этих сословиях.

Фамилия не имеет отношения к русским словам «мир» или «мур» — это чисто тюркское образование. Её однокоренные «родственники» — Исмагилов, Муратов, Исмухаметов — все они образованы по одному принципу: арабское имя + русский суффикс. Исмуратов среди них — один из самых компактных и звучных вариантов, сохранивший в основе имя, которое родители давали ребёнку как заветное желание.