Фамилия Ишмуратова — женская форма, а её основа — мужское имя Ишмурат. Эта модель образования типична для многих тюркских фамилий: к имени предка добавляли русский суффикс -ов/-ев, который затем склоняли по законам русского языка. В буквальном смысле Ишмуратова — «дочь или жена человека по имени Ишмурат».

Само имя Ишмурат — составное, и его разбор даёт ключ к пониманию того, как родители могли назвать сына. Первая часть, «иш», в тюркских языках многозначна. Одно из значений — «пара», «чётный», «дополнение». Это указывает на то, что ребёнок был не первым в семье, а как бы «прибавлением» к уже имеющимся детям. Другое, не менее важное значение — «товарищ», «спутник», «помощник». Вторая часть — арабское имя Мурат, означающее «желанный», «цель», «стремление». Соединившись, эти корни могли давать имя со смыслом «желанный товарищ» или «дополнительный, желанный ребёнок».

Интересно, что в некоторых говорах и диалектах основа «иш» могла также означать «ровня», «подобный». В таком случае имя Ишмурат осмыслялось бы как «подобный Мурату» или «равный Мурату» — возможно, в честь деда или уважаемого предка, носившего имя Мурат.

Фамилия Ишмуратова распространена преимущественно среди башкир и татар, что неудивительно: именно в этих тюркских народах двухосновные имена с элементом «иш» были особенно популярны. Встречаются и однокоренные фамилии — Ишмуратов, Ишмуратовы, а также варианты с другим суффиксом, например, Ишмуратовский, указывающие на иной путь оформления фамилии в дворянской или священнической среде.

Точное время и место возникновения конкретной ветви рода Ишмуратовых можно установить только через генеалогическое исследование. Однако ясно, что фамилия эта — не случайное прозвище, а осмысленное имя, данное предку в надежде, что он станет верным помощником и желанным продолжением рода.