Фамилия Ишмурова — женская форма, мужская — Ишмуров. Её основа восходит к тюркскому мужскому имени Ишмур, составленному из двух частей: «иш» (работа, дело, спутник) и «мур» (печать, знак). В буквальном смысле имя можно истолковать как «печать дела» или «знак соратника», но в быту оно скорее воспринималось как пожелательное: «пусть дело будет отмечено», «пусть у спутника будет своя метка». Имена с компонентом «иш» (Ишбулат, Иштуган) типичны для башкирской и татарской антропонимии, где «иш» часто означал «друг», «товарищ», «ровня».

Модель образования типична для русских фамилий из тюркского корня: к основе Ишмур прибавили русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Ишмуров). Замена «ы» на «и» в корне (Ишмур, а не Ышмур) — результат адаптации тюркского звучания к русской фонетике. В документах XVII–XVIII веков фамилия могла писаться через «ы» (Ышмуров), но к XIX веку закрепился современный вариант.

Географически фамилия встречается в регионах с компактным проживанием татар и башкир — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это указывает на происхождение из среды служилых татар, тептярей или башкирских вотчинников, которые при переходе в русское подданство получали фамилии по отцу. В отличие от многих крестьянских фамилий, закрепившихся после отмены крепостного права, Ишмуровы, скорее всего, носили свою фамилию уже к середине XVIII века — её фиксируют в ревизских сказках восточных губерний.

Интересная деталь: в некоторых говорах ударение падает на второй слог (Ишмýров), что сближает фамилию с окающими русскими говорами, хотя тюркская основа подразумевает ударение на последний слог (Ишмурóв). Этот разнобой — следствие долгого бытования фамилии в русскоязычной среде, где её подравнивали под привычные модели.