Фамилия Исомиддинов — яркий пример антропонимики, пришедшей из мусульманского мира, а точнее из персидско-таджикского языкового ареала. В отличие от славянских фамилий, которые часто заканчиваются на -ов/-ев от отчества, здесь суффикс -ов играет роль русификатора: его добавили в советское время, когда паспортизация требовала привести фамилию к единому стандарту. Корень же уходит в арабскую традицию.

Основа — личное имя Исомиддин. Оно сложное, образовано от арабских слов «исм» (имя, суть) и «дин» (вера, религия). Вместе это означает «имя веры» или «суть религии». В иранском и тюркском мире такие имена с компонентом «дин» давали в знак глубокой религиозности или по обету. Встречаются варианты Исматуддин, Исматдин — они от другого корня («исмат» — чистота, непорочность), но звучат схоже.

Географически фамилия Исомиддинов распространена в Таджикистане и Узбекистане, а также среди выходцев из этих стран. В России она редкая, встречается в диаспорах. Носители — потомки людей, чьи предки носили имя Исомиддин, что в традиционной культуре указывает на уважаемый род, возможно, связанный с духовенством или учёными. Однако утверждать, что все носители — потомки мулл, нельзя: имя могло быть дано и просто по благочестию.

Отметим, что в русском языке фамилия склоняется по мужскому роду: Исомиддинов, Исомиддинова, Исомиддинову. Женский вариант — Исомиддинова — не склоняется, если речь о женщине. В таджикской среде без суффикса -ов она звучала бы как Исомиддин — это отчество или полное имя, а не фамилия в привычном нам смысле.