Фамилия Истошина образована от мужского прозвища Истоша, которое, скорее всего, давали обладателю громкого, пронзительного голоса. Основа здесь — прилагательное «истошный», то есть отчаянный, резкий (обычно о крике). Однако у этого прозвища мог быть и второй смысл: в народе «истошным» иногда называли человека смелого, отчаянного в поступках. В русском языке слово «истошный» со временем закрепилось именно за голосом, но изначально его значение было шире — «крайний, доходящий до предела», что могло относиться и к характеру.

Интересно, что фамилия Истошина встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в старых переписях Вологодской и Костромской губерний. Это указывает на то, что прозвище Истоша бытовало именно там, где «истошный» в значении «отчаянный» ещё помнили как характеристику человека, а не только крика. В других регионах, ближе к югу, эта фамилия почти не фиксируется, что делает её локально привязанной.

По модели образования фамилия Истошина — типичная русская «патронимическая» форма: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Истоши). Это один из самых древних способов закрепить прозвище в роду. Родственные фамилии — Истошин, Истошнов (с другим суффиксом) — встречаются редко, что говорит о том, что прозвище не было массовым, а давалось по яркой, запоминающейся черте. Таким образом, носитель фамилии Истошина в прошлом — потомок человека, которого в округе знали либо по зычному голосу, либо по отчаянной смелости.