Фамилия Кабунин стоит в ряду самобытных памятников финно-угорской культуры, хотя её происхождение не сводится к одному корню. Начать стоит с прозвища Кабун, лёгшего в основу фамилии. Самая убедительная версия связывает его с коми-пермяцким словом «каб» — «колодка». Если так, то Кабун — это профессиональное прозвище сапожника или башмачника, человека, который работал с обувной колодкой. Это объяснение простое и прямое, без натяжек.

Есть и другие гипотезы. Караимская основа «кабун» означает «хвататься», и в этом случае прозвище могло характеризовать ловкого, хваткого в делах человека. Третья версия уводит в географию: в Молдавии существует село Старая Кабуна, и фамилию могли получить выходцы оттуда. Все три варианта имеют право на существование, но коми-пермяцкий след выглядит исторически более весомым, учитывая ареал бытования фамилии.

В любом случае, словообразовательная модель проста: к основе Кабун прибавили типичный русский суффикс принадлежности -ин, означающий «чей?» — то есть сын или потомок Кабуна. Фамилия зафиксирована в документах. В Книге памяти Краснодарского края упомянут Андрей Милентьевич Кабунин, 1883 года рождения, из станицы Успенской Белоглинского района. Эта запись — реальное свидетельство, что фамилия бытовала на Кубани среди крестьянского или казачьего сословия. Точное время и место возникновения фамилии Кабунин требует отдельных генеалогических изысканий, но уже ясно, что перед нами не случайный, а осмысленный след финно-угорского или, возможно, тюркского влияния в русском ономастиконе.