Фамилия Кахоров — один из тех случаев, где на первый взгляд очевидный корень может ввести в заблуждение. Самое простое объяснение — связать её с тюркским словом «кахор» (или «кахар»), которое в ряде языков означает «гнев», «ярость» или «бедствие». Однако в русской ономастике такая основа встречается крайне редко, и прозвище «Кахор» в значении «гневный человек» маловероятно — для тюркских прозвищ характерны другие модели.

Гораздо правдоподобнее версия, что фамилия имеет таджикское или персидское происхождение. В этих языках «кахор» (qahhor) переводится как «всемогущий», «могущественный» — один из эпитетов Всевышнего в исламской традиции. Соответственно, имя Кахор (или Каххор) давали мальчикам как благопожелательное, в надежде на силу и защиту. Фамилия Кахоров образована по русской патронимической модели: к восточному имени добавили типичный суффикс -ов, означающий «сын Кахора» или «потомок Кахора».

Формант -ов указывает, что фамилия складывалась в русскоязычной среде — скорее всего, при переписях населения в Средней Азии или в среде таджикских и узбекских переселенцев, контактировавших с русским делопроизводством. В самой Таджикистане или Узбекистане такая фамилия могла бы звучать как Кахоров, Кахорзода или просто Кахор — в зависимости от региона и эпохи.

Географически фамилия встречается в основном на юге Таджикистана (Хатлонская область) и среди таджикской диаспоры в России. В метрических книгах Российской империи она не фиксируется — это говорит о её относительно позднем закреплении, уже в советское время, когда массово выдавались паспорта с русифицированными окончаниями.

Спорный момент: иногда Кахоров путают с фамилией Кахаров, которая восходит к арабскому «каххар» (всемогущий) — это один из вариантов транслитерации того же корня. Разница в написании — «о» или «а» во втором слоге — может быть следствием диалектного произношения или ошибки писаря. Оба варианта по сути обозначают одно и то же: «сын человека, носящего имя Ках(х)ор».