Фамилия Какорников — редкая и морфологически прозрачная. Её основа — Какорник, а суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — сын Какорника. Вопрос упирается в то, что такое «какорник» и откуда это слово взялось.

Самая вероятная версия — профессиональное прозвище. В русских говорах, особенно северных и сибирских, «какора» — это коряга, суковатый пень, кривое дерево. Отсюда «какорник» — человек, который занимался заготовкой или обработкой такого леса: выкорчёвывал пни, делал из кривых стволов детали для саней, лодок или сельскохозяйственных орудий. Работа тяжелая, но востребованная в лесной местности. Прозвище могли дать и просто человеку коренастого, крепкого сложения — «как коряга».

Вторая версия, менее распространённая, выводит фамилию из диалектного «кокора» — то же самое, что и «какора», но с чередованием гласных. Такие колебания (о/а) в народной речи обычны. В этом случае Какорников — фонетический вариант фамилии Кокорников, которая тоже встречается, хотя и редко.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Предуралью. В метрических книгах XIX века Какорниковы фиксируются в Вятской и Пермской губерниях, а также в Симбирской. Это косвенно подтверждает «лесную» версию происхождения: именно там были развиты лесные промыслы и ремёсла, связанные с обработкой дерева.

Суффикс -ник в основе фамилии указывает на род занятий или характерный признак, а не на отчество от крестильного имени. То есть прозвище Какорник было образовано напрямую от нарицательного слова, а не от личного имени. Это отличает фамилию от более массовых Ивановых или Петровых и делает её ценной для генеалогии: предки Какорниковых, скорее всего, были не крестьянами-землепашцами, а людьми, связанными с лесным промыслом.