Фамилия Какушкины — яркий пример того, как необычное звучание может скрывать вполне прозрачное происхождение. Вопреки возможным ассоциациям с чем-то «какающим», корень здесь другой: фамилия образована от прозвища или имени Какушка. Это уменьшительно-ласкательная форма от имени или прозвища Кака, которое в древнерусском языке не имело современного брезгливого значения, а восходило к слову «какать» в смысле «пачкать, марать» или, по другой версии, к тюркскому «кака» — «старший брат, дядя». Второй вариант правдоподобнее: на Руси прозвища со значением родства (Дядя, Батя, Кака) давали детям, подчеркивая их положение в семье или внешнее сходство со старшим родственником.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Какушкины — это «дети Какушки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. Форма множественного числа (Какушкины) подчёркивает, что фамилия закрепилась за целым родом, а не за одним человеком, и часто встречается в старообрядческой или крестьянской среде, где семьи были большими и жили компактно.

Географически фамилия редкая и локальная. По данным переписей, основные очаги её бытования — Тверская, Псковская области и северо-запад России. В этих краях сохранились архаичные формы словообразования, а также диалектные слова, которые могли лечь в основу прозвища. Например, в тверских говорах «какушка» — это не только птица кукушка (с характерным чередованием к/ц), но и прозвище болтливого или суетливого человека.

Сословная принадлежность предков-Какушкиных, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилия не встречается в дворянских родословных книгах, что типично для имён, образованных от прозвищ с бытовой или родственной семантикой. В XIX веке носители фамилии могли быть государственными крестьянами или ремесленниками, жившими в небольших деревнях.

Интересно, что при всей редкости фамилия имеет несколько вариантов написания — Какушкин, Какушкины, а также искажённые формы вроде Кокушкины (под влиянием аканья). Но исходная форма именно с корнем «как-» и суффиксом -ушк-, что делает фамилию уникальным маркером северо-западного диалектного ареала.