Фамилия Калислямов — редкий пример, где тюркская основа встретилась с русским патронимическим суффиксом. Строение фамилии прозрачное: корень «Калислям» и суффикс «-ов», который в русской традиции означал «сын такого-то» или «принадлежащий такому-то». Мужские фамилии на «-ов» массово закрепились в XVI–XIX веках, когда крестьян и мещан записывали по отцу.

Самая вероятная основа — татарское или башкирское мужское имя Калислям. Оно составное: первая часть «кали» восходит к арабскому «калим» (говорящий, собеседник) или к «кали» (чистый, святой). Вторая часть — «слям» — искажённое арабское «салям» (мир, благополучие). В исламской ономастике такие имена с корнем «салям» давали с пожеланием мирной жизни или в честь одного из эпитетов Всевышнего. Полное имя Калислям могло означать «чистый мир» или «говорящий о мире».

Встречается и другая версия: фамилия могла образоваться от прозвища Калислям, которое в тюркской среде давали человеку, постоянно желавшему мира или произносившему приветствия. Прозвища часто становились фамилиями, когда сына начинали звать по отцу — Калислямов сын.

Географически фамилия привязана к Волго-Уральскому региону: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Здесь у татар и башкир в XVII–XIX веках активно шёл процесс русификации фамилий — к тюркскому имени добавляли русский суффикс. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, реже — к служилым татарам.

Суффикс «-ов» здесь не случаен: в отличие от фамилий на «-ин» (от основ на -а/-я), «-ов» крепится к твёрдым согласным, и «Калислям» — мужское имя с конечным «м», что дало именно эту форму. Если бы фамилия осталась в чисто татарской среде, она могла бы звучать как Калислямов (с ударением на последний слог) или без суффикса — просто Калислям.