Фамилия Калмаганбетов — редкий пример, где корень не славянский, а тюркский, а суффикс — русский патронимический формант -ов. Это типичная «гибридная» фамилия, возникшая на стыке культур, когда в Российской империи нерусским народам давали фамилии по русской модели: к имени отца добавляли суффикс принадлежности.

Основа — личное имя Калмаганбет. Оно составное, казахского происхождения. Первая часть, «Калмаган», скорее всего, восходит к глаголу со значением «не остался», «не отстал» или к имени с отрицательной частицей (калма — «останься» + ган — аффикс прошедшего времени). Вторая часть — «бет» (или «бек») — титул, означающий «господин», «князь», «начальник». В тюркской антропонимике такие имена-обереги были распространены: родители давали ребёнку имя, которое должно было защитить его от злых духов или бед, — например, «тот, кто не остался (в прошлом)» или «неотступный господин».

Модель образования проста: имя Калмаганбет + русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Калмаганбетов). Буквально фамилия означает «потомок Калмаганбета». Встречается она почти исключительно у казахов, особенно в Западном Казахстане (Актюбинская, Атырауская области), а также среди казахской диаспоры в России — в Оренбургской, Астраханской, Саратовской областях.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии — потомки кочевников-скотоводов, которые получили фамилию при переписях и паспортизации в XIX — начале XX века. В отличие от русских фамилий, которые часто образовывались от прозвищ или ремёсел, Калмаганбетов — это прямое отчество от полного имени, без переосмысления. Встречаются варианты написания: Калмаганбетов, Калмаганбет (без суффикса) или с усечением до Калмаган. Фамилия не частотна: по открытым данным, в России её носят не более нескольких сотен человек, что делает каждую семейную ветвь легко прослеживаемой по региону.