Фамилия Калмагоров — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем прямой разбор корня. Носители этой фамилии почти наверняка происходят из районов Русского Севера или Вятки, где «калмагор» — это местное, диалектное слово. В архангельских и вологодских говорах так называли жителя Холмогор, то есть человека из села Холмогоры или прилегающих земель. Переход «холмогор» → «калмагор» — явление фонетическое: северные говоры «акали» и упрощали начальное «хл» до «кл» в быстрой речи. То есть Калмагоров — это «холмогорец», а фамилия образована по типичной модели «прозвище по месту жительства + суффикс -ов».

Суффикс -ов указывает на патронимический характер: «чей?» — Калмагоров, то есть сын или потомок Калмагора. Само прозвище Калмагор, как и многие северные прозвища, могло закрепиться за человеком, который перебрался из Холмогор в другую местность — например, на Вятку или в Пермский край. Там его и окрестили «калмагором» как пришлого, а потом это стало фамилией его детей.

Есть и вторая, менее вероятная версия. В некоторых тюркских языках «калмак» означает «остаток» или «оставшийся», а «гор» могло быть искажением от «оглы» (сын). Но эта гипотеза слабая: фамилия Калмагоров не встречается в среде поволжских татар или башкир, зато плотно привязана к русскому Северу. Кроме того, суффикс -ов — типично русский, а не тюркский, что делает первую версию единственно правдоподобной.

Интересно, что фамилия Калмагоров — это «скрытый топоним». В отличие от фамилий вроде Московкин или Тверской, где географическая основа очевидна, здесь она замаскирована под диалектное произношение. То же самое мы видим в фамилиях Калганов (от «колган» — бугор, курган) или Калмыков, но у Калмагоровых связь с Холмогорами — самая прямая.

Исторически Холмогоры — крупное село на Северной Двине, центр торговли и административный пункт. Крестьяне, ремесленники и купцы оттуда расходились по северным уездам, и прозвище «холмогорец» (а в местном говоре — «калмагор») было для них естественным маркером. Так что предки Калмагоровых, скорее всего, были выходцами из-под Архангельска, переселившимися вглубь страны в XVII–XVIII веках.