Фамилия Кальсина образована от прозвища Кальс, которое, скорее всего, восходит к греческому слову «кальс» — «известь». Такое прозвище могли дать человеку с очень бледной кожей, буквально «белому как известь». Но есть и вторая, не менее вероятная версия: прозвище могло закрепиться за тем, кто профессионально занимался добычей, обжигом или использованием извести. Известь, смешанная с песком, — древнейший строительный материал, известный ещё со времён Моисея; её применяли для оштукатуривания стен и потолков в храмах. Поэтому Кальсом могли прозвать и строителя, и штукатура.

Фамилия стоит в женской форме (Кальсина), мужской вариант — Кальсин. По модели образования это типичная «-ин» фамилия, указывающая на принадлежность: «чей сын?» — Кальсин, то есть сын Кальса. Подобные фамилии широко распространены в северных и центральных регионах России, хотя сама основа Кальс встречается редко. Сравните с однокоренными фамилиями, образованными от названий материалов или профессий: Известкин, Глинин, Песцов. В отличие от них, Кальсина сохранила прямую связь с греческим заимствованием, что делает её особенно интересной для этимолога.