Фамилия Канеева — женская форма фамилии Канеев. В русской традиции такие фамилии образуются по простой модели: к мужской основе добавляется окончание -а. Поэтому, чтобы понять происхождение, нужно разобрать мужской вариант — Канеев.

Основа фамилии — «Каней». Это древнерусское нецерковное имя или прозвище. В старину на Руси было широко распространено имя Каней (уменьшительное от Канила), которое, в свою очередь, восходит к каноническому имени Канидий. Канидий — имя греческого происхождения, означающее «светящийся», «блистающий». В просторечии оно сократилось до Каней, а затем к нему добавился типичный русский фамильный суффикс -ев, указывающий на принадлежность: Канеев — сын Канея.

Впрочем, есть и другая, более прозаичная версия. В северных русских говорах (особенно в Архангельской и Вологодской областях) словом «каня» называли ленивого, медлительного человека. «Ну и каня ты, еле ноги переставляешь», — могли сказать о таком. Прозвище Каней могли дать нерасторопному или флегматичному крестьянину. От этого прозвища и пошла фамилия. Эта версия выглядит правдоподобнее, так как мирские прозвища были в ходу гораздо чаще, чем редкие календарные имена вроде Канидий.

Географически фамилия Канеев (и Канеева) чаще всего встречается на Русском Севере, в Поволжье и в некоторых регионах Урала. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были, скорее всего, государственными или дворцовыми крестьянами, а не помещичьими, так как на Севере крепостное право было развито слабо.

Интересная деталь: фамилия Канеев не имеет отношения к тюркским языкам, хотя по звучанию напоминает многие татарские или башкирские фамилии (например, Канеев у татар существует, но там основа — «кан» — кровь или хан). Русская фамилия Канеев — исконно славянская, и путать их не стоит. Если ваши предки из Вологодчины или Архангельской губернии, то, скорее всего, в основе лежит именно северное прозвище «каня».