Фамилия Канеев происходит от личного имени Каней — диалектной формы арабского имени Кан или Кана. В переводе с арабского это имя означает «кровь» или «кровный». Такое имя давали с пожеланием, чтобы у ребёнка сложилась счастливая и благополучная жизнь, — за именем стояло представление о кровной связи, родственной близости и крепости рода.

По словообразовательной модели фамилия Канеев — типичная русская патронимическая фамилия на -ев. Суффикс -ев присоединялся к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или й (в данном случае к основе Каней). Фамилия означает «сын Канея» или «потомок Канея». Такая модель была особенно распространена в среде крестьян и мещан после отмены крепостного права, когда фамилии массово закреплялись за целыми семьями.

С географией фамилии интересная деталь: фамилия Канеев встречается в нескольких регионах, но особенно заметна в Поволжье и на Урале. Это может указывать на то, что носители фамилии — потомки тюркоязычных или финно-угорских народов, принявших православие и получивших фамилию по крестильному или прозвищному имени. В татарской среде имя Кан (Кана) также бытовало, но с другим значением: «хан», «владыка». Поэтому не исключено, что в некоторых случаях корень фамилии восходит к тюркскому «кан» — «хан», а не к арабскому «кровь». Обе версии имеют право на существование, и разобраться, какая верна для конкретной семьи, можно только по истории рода.

В целом фамилия Канеев — редкая, нечастотная. Её носители, судя по архивным записям, были в основном крестьянами и мещанами, а в советское время — рабочими и служащими. Известных общественных деятелей или знаменитостей с этой фамилией нет, поэтому каждый носитель может считать себя первооткрывателем собственной семейной истории.