Фамилия Канеская — редкий пример модели, где суффикс -ск- присоединён к основе, которая сама по себе не является географическим названием. В массе русских фамилий на -ский/-ской за этим суффиксом стоит топоним: село, город или река. Но в случае Канеская основа «Кане» не отсылает к известному населённому пункту. Это заставляет искать другое объяснение — и оно лежит в области прозвищ или адаптированных иноязычных имён.

Самый вероятный путь образования: от прозвища Каней или Кана. В русских говорах «каня» — хищная птица из семейства ястребиных, полевой лунь. Прозвище Каней могли дать человеку с острым зрением, стремительным нравом или даже с характерной внешностью (например, светлые, «лунные» глаза). Фамилия, образованная от такого прозвища через суффикс -ск-, указывает на принадлежность: «Канеская» буквально значит «относящаяся к Канею» или «из рода Канея». Вариант с окончанием -ая (а не -ий) типичен для женской формы фамилии, которая в русской традиции могла закрепиться за целым родом, если носительницей-основательницей была женщина.

Менее распространённая, но возможная версия — польское или белорусское происхождение. В польском языке есть фамилия Kaniewski/Kaniewska, которую в русской записи могли передать как Каневская, а затем, при неточном написании или в результате диалектного произношения, — как Канеская. Потеря буквы «в» в суффиксе — характерная черта для фамилий, записанных на слух в XIX веке чиновниками, не знакомыми с местными говорами. В этом случае фамилия могла указывать на выходцев из села Канев (есть в Польше и на Украине) или на владельцев поместья Канево.

География фамилии узкая. В современных базах данных Канеская встречается единично, преимущественно на юге России и в Краснодарском крае, что косвенно подтверждает версию о прозвищном происхождении: в казачьей среде прозвища от названий птиц были обычным делом. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Канéская.