Фамилия Капаус — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а западное, и чтобы понять, откуда она взялась, нужно отбросить привычную модель «Иван — Иванов». В русских фамилиях на -ус обычно видны следы полонизации или латинизации, а Капаус — скорее всего, германская или прибалтийская фамилия, записанная на слух русскими писарями.

Самый вероятный корень — немецкое слово Kapaun или Kapau(n)s, которое восходит к латинскому capo, caponis — каплун, то есть холощёный петух, откармливаемый на мясо. В южнонемецких диалектах и в баварском произношении это слово звучало как «капаус». Фамилия могла быть прозвищем птицевода, торговца птицей или, в переносном смысле, — человека, которого дразнили за полноту или оседлый образ жизни. Встречается она в Австрии, Баварии и у судетских немцев, откуда могла попасть в Российскую империю вместе с колонистами или переселенцами.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с литовским или латышским словом kapas (могила) или kapa (куча, груда), но для образования фамилии на -ус это менее типично. В прибалтийских языках фамилии с таким окончанием чаще имеют немецкое происхождение, так что германский след остаётся главным.

В России фамилия Капаус встречается единично, в основном на юге и в Поволжье — там, где в XVIII–XIX веках селили иностранных колонистов. Носители могли быть из числа обрусевших немцев, и писарь на русской службе записал фамилию так, как услышал, без переделки на «-ов» или «-ин». Суффиксальная модель тут отсутствует: это чистая основа, заимствованная целиком, что для русской фамильной системы редкость и сразу указывает на иноязычное происхождение. Никаких «известных носителей» в истории не зафиксировано — фамилия осталась на периферии, но именно поэтому она ценна как маркер сложных миграционных процессов.