Фамилия Капичникова — женская форма, исходная мужская — Капичников. В её основе лежит прозвище Капичник. Чаще всего его связывают с украинским словом «капці» — «опорки, лёгкие домашние туфли». Скорее всего, так называли мастера, который шил или чинил такую обувь. Украинский корень не случаен: фамилия распространена в южнорусских и украинских говорах, что подтверждает эту версию.

Есть и другое объяснение. В белорусском языке есть слово «капец» — «межевой знак, земляная насыпь». В этом случае Капичником могли прозвать землемера или человека, который занимался разметкой участков. Оба корня — «капці» и «капец» — дают одинаковую словообразовательную модель: основа + суффикс -ник (обозначает род занятий), к которому добавился типичный русский суффикс фамилий -ов.

С точки зрения морфологии, фамилия Капичникова — притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?». Суффикс -ов указывает на принадлежность: потомок Капичника. Это одна из самых распространённых моделей русских фамилий, но редкая основа делает её заметной.

Интересная деталь: в дореволюционных переписях фамилия почти не встречается — это говорит о том, что она либо локальная, либо возникла позже, уже в советское время, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам. Географически фамилия тяготеет к Курской, Белгородской и Воронежской областям, что сближает её с украинским влиянием. Прямых указаний на дворянское происхождение нет — скорее всего, это фамилия ремесленников или сельских работников.