Фамилия Карабалин — типичный пример русской фамилии, образованной от личного имени. Её основа — сложное тюркское имя Карабала, которое складывается из двух корней: «кара» и «бала». В фамилии эти корни соединил суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Карабалин, то есть сын или потомок Карабалы.

Первая часть имени — «кара» — восходит к тюркскому слову qara, у которого множество значений. Это и «чёрный цвет», и «грозный, сильный», и «обильный, богатый», и «главный, великий», и даже «простой народ». В именах этот корень чаще всего использовался как усилитель качества: «великий», «могучий» или как обозначение цвета — «черноволосый», «черноглазый». Вторая часть — «бала» — происходит от турецкого bala, что означает «дитя», «ребёнок». Таким образом, имя Карабала можно перевести как «великий ребёнок» или «могучий малыш» — вероятно, оно было пожелательным: родители надеялись, что сын вырастет сильным и влиятельным человеком.

Модель образования фамилии — тюркское имя + русский суффикс -ин — очень распространена в Поволжье, Приуралье и Сибири, где русские контактировали с тюркскими народами. Фамилия Карабалин могла появиться в среде крещёных татар, башкир или казахов, чьи предки носили традиционные двусоставные имена. Позже, при переходе в русскую культуру, к имени добавился фамильный суффикс, и оно закрепилось в документах.

Стоит отметить, что фамилия Карабалин — не единственная в этом ряду. Есть и более распространённые Карабаевы (от имени Карабай — «богатый мальчик»), и Карабановы (от Карабан — «чёрный господин»). Карабалин стоит особняком: суффикс -ин указывает на конкретное лицо, а не на род, что делает фамилию более «личной» по происхождению. Встречается она реже, чем однокоренные варианты, и чаще всего в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане — именно там исторически было много тюркского населения, принимавшего православие и вместе с ним русские фамилии.