Фамилия Карабекян — типичный пример армянской фамилии, образованной по модели, которая сложилась в XIX веке. Её основа — «Карабек», а суффикс «-ян» (в старой орфографии «-янц») указывает на принадлежность к роду или происхождение: «из рода Карабека», «потомок Карабека». Это одна из самых распространённых фамильных моделей в Армении, аналогичная русским фамилиям на «-ов».

Сама основа «Карабек» — составное тюркское имя, которое проникло в армянскую среду через многовековые контакты с соседними народами. Первая часть, «кара», в тюркских языках означает «чёрный» или «тёмный», но в составе имён часто теряет прямой цветовой смысл и приобретает значение «сильный», «могучий» или же указывает на старшинство. Вторая часть, «бек», — это титул, обозначающий князя, господина или предводителя. Таким образом, имя Карабек можно перевести как «чёрный (сильный) князь» или «старший бек». В армянской среде такие тюркские имена не были редкостью, особенно в регионах, долгое время входивших в состав Османской империи или Персии.

Скорее всего, первый носитель имени Карабек был человеком уважаемым, возможно, обладал властью или богатством, либо получил такое имя как прозвище за свою силу, суровость или тёмный цвет волос. Фамилия закрепилась за его потомками, и сегодня Карабекяны встречаются как в самой Армении, так и в диаспоре — в России, Грузии, странах Ближнего Востока и Европы. География фамилии во многом повторяет маршруты армянских миграций, особенно после геноцида 1915 года.

Интересно, что в русском языке фамилию часто склоняют, хотя по правилам армянские фамилии на «-ян» обычно не изменяются по падежам. В быту можно услышать и «Карабекяна», и «Карабекяну», что говорит о глубокой ассимиляции носителей в русскоязычной среде.