Фамилия Карабекова образована от восточного мужского имени Карабек, которое является составным и восходит к двум тюркским словам: «кара», что в переводе на русский язык означает «большой, сильный» и «бек» - «господин, предводитель». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Карабековых можно лишь на основании генеалогических исследований.