Фамилия Карабутина хранит память о прозвище или имени дальнего предка. В её основе лежит слово «Карабута». Точное происхождение этого слова спорно, и у специалистов есть как минимум две версии.

Первая версия связывает фамилию с тюркскими языками. Имя Карабута могло быть составным: «кара» (в тюркском — «большой», «сильный») и «бута» («дитя»). То есть буквально — «крепкое дитя», «сильный ребёнок». Такие имена-пожелания были распространены в среде, где ребёнку хотели передать силу или защитить его.

Вторая версия — чисто русская, бытовая. Она выводит прозвище Карабута от глагола «карабить», то есть «боронить», «рыхлить землю». В таком случае прозвище давали крестьянину-землепашцу, указывая на его занятие. Слово «карабить» встречается в южнорусских говорах, что даёт намёк на возможную географию фамилии. Эта версия выглядит правдоподобнее, потому что объясняет прозвище через конкретное ремесло, а не через гипотетическое заимствование.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин: от основы на -а (Карабута) к фамилии Карабутин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Карабуты». Такой способ типичен для фамилий, возникших в крестьянской и мещанской среде в XVI–XVII веках. Сословная принадлежность Карабутиных, скорее всего, была крестьянской или посадской — это подтверждает и «земледельческая» версия прозвища.

Таким образом, фамилия Карабутина — либо память о тюркском имени-пожелании, либо, что более вероятно, след крестьянского прозвища, данного по работе. В любом случае, она недвусмысленно указывает на занятие или характер предка, а не на географию или дворянский титул.