Фамилия Кардонские — редкий пример фамилии, в основе которой почти наверняка лежит географическое название, а не профессиональное прозвище или личное имя. Такие фамилии на -ский/-ской традиционно указывали на связь с местностью: либо владельческую (дворяне брали фамилию по названию своего поместья), либо по месту рождения или проживания человека. В случае с Кардонскими исходным пунктом могло стать село, деревня или местечко с корнем «Кардон-» или «Кардан-». Такие названия встречаются в исторических документах на территории современной Польши, Беларуси и Украины, где в прошлом были распространены еврейские общины.

Слово «кардон» в европейских языках имеет несколько значений. В итальянском и французском это чертополох или репейник, а также может относиться к картону или плотной бумаге. Однако для фамилии более вероятна связь с тюркским или персидским «кардан» — «делать, совершать», которое в виде топонима могло означать «место, где что-то делают» или «постоянное стойбище». В польском языке «kardon» — устаревшее название артиллерийского заряда, но эта версия менее правдоподобна для фамилии.

Фамилия Кардонские могла возникнуть и в среде еврейского населения, где формант -ский часто присоединяли к названиям местечек (штетлов), чтобы обозначить выходца оттуда. В отличие от ашкеназских фамилий с немецкими суффиксами -зон, -ман или -кинд, окончание -ский указывает на славянское влияние, характерное для евреев, живших на землях Речи Посполитой и Российской империи. Таким образом, предки носителей фамилии Кардонские, скорее всего, происходили из населённого пункта с похожим названием, а сама фамилия закрепилась за ними как указание на родину. Точное место и время её возникновения можно установить только через архивные поиски и генеалогические изыскания.