Фамилия Каркохин — редкий пример, где фамильный суффикс -ин скрывает необычную и, скорее всего, финно-угорскую основу. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ин, образованных от имён и прозвищ на -а/-я (Петя — Петин, рыба — Рыбин), здесь мы имеем дело с корнем, который не сразу поддаётся славянской этимологии.

Наиболее вероятное объяснение ведёт к карельскому или вепсскому слову «karkkoi» — так называли глухаря. В диалектах Прионежья и Карелии это слово бытовало как прозвище для человека — возможно, за глуховатость, крупное телосложение или особую манеру поведения. Прозвище Каркох превратилось в фамилию через стандартный русский суффикс принадлежности -ин, то есть «сын Каркоха». Подобные заимствования из прибалтийско-финских языков нередки на Русском Севере: вспомните фамилии Репин (от «репя» — лиса) или Кокорин (от «kokko» — орёл).

Вторая гипотеза, менее убедительная, связывает фамилию с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках есть слово «карк» — ворон или нечто тёмное, но для фамилии Каркохин это даёт слишком натянутую цепочку. География распространения фамилии — если судить по данным переписей и архивов — сосредоточена в Вологодской и Архангельской областях, что подтверждает северное, финно-угорское происхождение.

Словообразовательно фамилия проста: основа Каркох- (от прозвища Каркох) плюс суффикс -ин, указывающий на прямого потомка. Интересно, что в говорах сохранилась и форма Каркохов — с суффиксом -ов, что говорит о возможном колебании в документах XIX века, когда писарь мог записать фамилию на слух, не зная её точного происхождения.

Что касается социального статуса, предки Каркохиных, скорее всего, были государственными крестьянами или монастырскими работниками на севере России. Глухарь — птица лесная, и прозвище могло закрепиться за охотником или лесорубом. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, так что это крестьянская фамилия, типичная для Поморья и Заонежья.