Фамилия Карнезян — редкий пример армянской фамилии, образованной не от имени или профессии, а от прозвища, которое, скорее всего, описывало внешность или характер предка. Основа «карнез» восходит к армянскому слову «карниз» (գարնի) — «ягнёнок», но в переносном смысле могла означать «кроткий», «безобидный» или, наоборот, «упрямый, как баран». Другая, менее вероятная версия связывает корень с диалектным «кар» — «камень», то есть «каменный», «твёрдый», что тоже могло быть прозвищем стойкого или сурового человека.

Суффикс «-ян» — самый распространённый в армянских фамилиях, он указывает на принадлежность к роду (буквально «из рода Карнеза»). В отличие от русских фамилий, где суффиксы привязаны к сословию (крестьяне — на «-ов», дворяне — на «-ский»), армянский «-ян» универсален: его носили и ремесленники, и священники, и князья. Поэтому по суффиксу социальный статус предка не определить — важно само прозвище.

Интересно, что фамилия Карнезян почти не встречается за пределами Армении и армянской диаспоры. Это говорит о том, что она возникла в одной конкретной местности, возможно, в одном из сёл исторической Западной Армении или области Сюник. Если предок был ремесленником, то, скорее всего, скотоводом или пастухом — прозвище «ягнёнок» для такого человека было бы естественным.

Единственная морфологическая особенность: в русском языке фамилия склоняется по правилам мужского рода (Карнезяна, Карнезяну), но женский вариант остаётся неизменным (Анна Карнезян). В самой Армении фамилия пишется как Գառնեզյան, и там ударение падает на последний слог — КарнезЯн.