Фамилия Карнецкий — одна из тех, что образованы по модели, характерной для польской и западнорусской шляхты. Суффикс -цкий (в русской передаче -ский) указывает на дворянское или, как минимум, землевладельческое происхождение: так называли по названию имения или местечка. В основе фамилии лежит топоним Карница или Карнец — такие названия встречаются в Польше, Беларуси и на Украине. Например, есть село Карница на Подляшье и несколько деревень с корнем «карн» в западных областях. Человек, владевший землей в таком месте или оттуда родом, получал прозвание «Карнецкий» — то есть «из Карницы».

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища Карнец, которое могло восходить к древнерусскому «карать» (наказывать) или к диалектному «карный» (черный, смуглый). Однако для фамилий на -ский прозвищная основа — редкость, чаще это все-таки географический признак. В пользу топонимического происхождения говорит и то, что в старых документах фамилия встречается преимущественно в западных губерниях Российской империи — Могилевской, Витебской, Волынской.

С точки зрения словообразования, фамилия прошла полонизированный путь: польский суффикс -cki адаптирован в русском языке как -цкий, а конечное -ий — типичное русское окончание прилагательного. В дореволюционных записях можно встретить вариант «Карнецкій» с «і» на конце.

Сословно носители фамилии в основном принадлежали к мелкопоместной шляхте или к однодворцам — потомкам служилых людей, которые после разделов Речи Посполитой оказались в составе Российской империи и постепенно смешались с крестьянством. Поэтому, если ваши предки — Карнецкие, скорее всего, они были землевладельцами в небольшом поместье где-то на западе современной Беларуси или Украины.