Фамилия Карпейкин образована по простой и прозрачной модели: от личного имени Карпейка — уменьшительной формы крестильного имени Карп. Само имя Карп восходит к греческому «karpos» («плод», «приносить пользу»), так что в основе лежит пожелательное значение, связанное с плодородием и благополучием. Уменьшительный суффикс -ейк- в имени Карпейка — характерная черта народной разговорной традиции, где полное имя сокращали и смягчали, добавляя ласкательный или обиходный оттенок. Фамилии на -ин образованы от основ на -а/-я: Карпейка → Карпейкин, то есть «сын Карпейки» или «потомок того, кого звали Карпейка». По сравнению с более частыми фамилиями Карпов или Карпухин, вариант Карпейкин встречается реже и сохраняет след именно той ветви, где предка называли не полным именем, а его уменьшительной формой. В документах и переписях фамилия фиксируется преимущественно в центральных и южнорусских регионах, где имя Карп было распространено среди крестьян и мещан.