Фамилия Карпейко отчетливо говорит о своем происхождении: перед нами типичная украинская или белорусская фамилия, образованная по модели «сын такого-то». В ее основе лежит имя Карпей — народная, разговорная форма канонического мужского имени Карп. Само имя Карп пришло на Русь из греческого языка, где слово «карпос» означало «плод» и, в более широком смысле, «приносить пользу». Таким образом, имя было пожелательным: родители нарекали им ребенка в надежде, что он вырастет полезным человеком.

В имени Карпей видна характерная восточнославянская адаптация: окончание -ей часто добавлялось к основам имен, делая их более привычными для бытового общения (сравните: Иван — Иваней, Юрий — Юрей). Суффикс -ко в фамилии Карпейко — один из самых распространенных в украинской и южнобелорусской ономастике. Он выполнял роль уменьшительно-патронимического показателя, то есть буквально означал «маленький» или «сын». Поэтому фамилию Карпейко следует понимать не как «сын Карпа», а именно как «сын Карпея» — человека, которого в семье или в округе звали не полным церковным именем, а его домашней формой.

С точки зрения географии, фамилия с таким суффиксом наиболее характерна для земель современной Украины, особенно для ее центральных и северных областей, а также для юго-восточных регионов Беларуси. Встречаемость фамилии в России, скорее всего, связана с миграцией выходцев из этих регионов. В отличие от фамилий на -ов/-ев (Карпов), которые закрепились в центральной России, форма на -ко указывает на более позднее формирование фамилии в крестьянской среде, где патронимические прозвища долго не были закреплены официально.

Интересно, что имя Карп, в отличие от многих других календарных имен, не потеряло своей популярности и в XX веке, хотя и оставалось редким. Соответственно, фамилия Карпейко, при всей своей прозрачности, не так распространена, как, скажем, Карпов. Это делает ее хорошим маркером регионального происхождения предков: скорее всего, родоначальник жил в зоне украинского или белорусского влияния и был назван в честь святого Карпа, память которого отмечается в православной церкви. Никакой иной, не связанной с именем, версии происхождения этой фамилии не существует — корень здесь однозначен.