Фамилия Касекеев — редкий пример, где географический корень почти наверняка перевешивает антропонимический. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или прозвищ, эта фамилия, скорее всего, ведёт начало от топонима — названия казахского села Каскелен или реки Каскеленки в Алматинской области. Форма «Касекеев» могла появиться в результате адаптации исходного «Каскеленов» или «Каскелеев» при записи в русских документах: звук «л» выпал, а гласные редуцировались до привычного для русского уха окончания на -еев.

Суффикс -еев указывает на притяжательную модель: «чей?» — Касекеев, то есть сын или потомок человека по прозвищу Касекей. Само слово «Касекей» — это русифицированная форма казахского «Каскелен», где «каске» означает «быстрый, резвый» (о коне), а «лен» — суффикс принадлежности. В переносном смысле так могли прозвать человека за быстроту, ловкость или за то, что он родом с берегов одноимённой реки. В казахской ономастике фамилии на -ев распространены шире, чем русские -ов, поэтому версия с этническим происхождением предков выглядит убедительнее, чем гипотеза о чисто русском прозвище.

Встречается фамилия преимущественно в южных регионах Казахстана и в прилегающих областях России (Оренбургская, Астраханская), что подтверждает её локальный характер. В дореволюционных метрических книгах она почти не фиксируется — это говорит о том, что фамилия оформилась достаточно поздно, в XIX — начале XX века, когда казахам начали массово присваивать фамилии по месту жительства или по имени отца. Социально предки носителей фамилии, вероятно, были скотоводами или крестьянами-переселенцами, осевшими вблизи водных источников.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком: в русских фамилиях на -еев основа редко бывает трёхсложной и неясной этимологии. Сравните с однокоренными «Каскеленов» или «Каскеев» — они встречаются ещё реже и указывают на ту же географическую привязку. Если ваш предок носил фамилию Касекеев, велика вероятность, что его семья происходила из окрестностей современного Каскелена — города-спутника Алматы, известного с XVIII века как зимовье кочевников.