Фамилия Кацека — редкий случай, когда географическое происхождение почти очевидно, а вот корень слова вызывает споры. С высокой вероятностью, это украинская или польская фамилия, образованная от прозвища. Суффикс -ка в восточнославянских фамилиях часто указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму имени или профессии, но в данном случае он входит в основу, а не в окончание.

Самая прямая версия связывает фамилию с польским словом «kacek» — так в некоторых диалектах называли утёнка или маленькую утку. Прозвище «Кацека» мог получить либо птицелов, либо человек, чем-то напоминавший утку — например, походкой или голосом. В польской ономастике такие «птичьи» фамилии встречаются часто: Качка, Качор, Качковский. Кацека — их менее распространённый вариант.

Вторая версия менее очевидная, но возможная: фамилия могла возникнуть из западноукраинского диалекта, где «кацка» — уменьшительное от «качка» (утка). Переход «ч» в «ц» (качка → кацка) — явление, характерное для говоров Галиции и Волыни. Тогда Кацека — это тот же «утёнок», но в местном произношении.

Третья гипотеза отсылает к еврейскому происхождению. В идише есть слово «кац» (כץ) — сокращение от «коэн-цедек» (праведный священник), и фамилии вроде Кац, Кацман, Кацевич широко распространены среди ашкеназов. Фамилия Кацека могла возникнуть как полонизированная форма с уменьшительным окончанием -ека, но это менее вероятно: обычно такие формы заканчиваются на -ович или -ский.

Встречается фамилия Кацека и в России, но это, скорее всего, следствие миграции из западных губерний. По сословной принадлежности предки могли быть как крестьянами, так и мещанами — точных данных нет. В любом случае, основа фамилии — прозвище, связанное с птицей или, реже, с сакральным титулом, что делает её одновременно простой и неоднозначной.