Фамилия Каупыш — редкий пример того, как русская по форме фамилия может иметь литовские корни. Суффикс -ыш указывает на принадлежность к восточнославянской модели образования: в русском, украинском и белорусском языках так часто создавали прозвища (Малыш, Голыш, Дурныш). Но основа у фамилии иная.

Разбираем её значение. По одной из версий, в основе лежит литовский глагол kaupti — «окучивать, мотыжить». Тогда прозвище Каупыш получал крестьянин-земледелец, человек, чья работа была связана с обработкой почвы. По другой версии, фамилию породило литовское существительное kaupas — «куча корнеплодов, картофеля, сложенная на земле и укрытая для длительного хранения; бурт». В этом случае предок Каупыш мог заниматься выращиванием и продажей овощей.

Обе гипотезы правдоподобны: они не противоречат друг другу, а просто описывают разные стороны одного крестьянского быта. Важно, что фамилия не дворянская и не книжная — она вышла из народной среды, из речи литовских или белорусских земледельцев, чьё прозвище потом закрепилось в документах.

С точки зрения географии, фамилия Каупыш тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — территориям современной Литвы, Беларуси и Смоленщины. В центральных русских областях она почти не встречается, что подтверждает её балтское происхождение.