Фамилия Каупин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Сразу скажем: в списках типичных русских фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), её нет. Её основа, скорее всего, не славянская, а иноязычная, и география бытования — главная подсказка.

Словообразовательная модель простая: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). В русской традиции так образовывались фамилии от основ, оканчивающихся на -а или -я (сын Каупы → Каупин). Значит, в основе лежит прозвище или имя Каупа.

Самая правдоподобная версия ведёт на северо-запад России, в Карелию или Прибалтику. В карельском и финском языках есть слово kauppa — «торговля», «магазин», «товар». Человека могли прозвать Кауппа (или Каупа) за то, что он был купцом, торгашом или просто жил при торговом месте. Фамилии с корнем Kaupp (Кауппи, Кауппонен) распространены в Финляндии. В русском Приладожье и на Карельском перешейке такие прозвища могли адаптироваться с русским суффиксальным оформлением, дав фамилию Каупин.

Менее вероятная, но возможная версия — от немецкого или шведского личного имени. В балтийско-немецкой среде встречалась фамилия Kaup (от средневерхненемецкого kouf — «покупка», «торговля»). Если предок был выходцем из немецких колонистов или шведских дворян, то фамилия могла русифицироваться: Кауп → Каупин.

Есть и гипотеза, что корень «кауп» может быть связан с диалектным русским словом, но надёжных подтверждений этому нет. В словарях русских народных говоров такое слово не фиксируется.

Таким образом, с высокой долей вероятности предок носителя фамилии Каупин был связан с торговлей и жил на северо-западе исторической России — в Карелии, Ингерманландии или Прибалтийском крае. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, и её редкость говорит о локальном происхождении, возможно, от одного небольшого рода.