Фамилия Каупина — редкий случай, когда географический и языковой контекст почти однозначно указывает на происхождение, но при этом сама фамилия почти не встречается за пределами одного региона. Есть все основания считать её карельской или финской по корню.

Основа — «кауппа» (kauppa), что на финском и карельском означает «торговля», «магазин» или «сделка». Отсюда легко образуется прозвище Кауппа (Kauppa) — «торговец», «купец». Фамилии на -ин в русской среде часто образовывались от прозвищ на -а/-я: Каупа → Каупин, а Каупина — это женская форма или форма родительного падежа. Но тут есть важная деталь: суффикс -ин в прибалтийско-финской ономастике не обязательно русский. В карельских фамилиях -ин мог быть адаптацией местного суффикса принадлежности, поэтому Каупина может быть исходной формой, а не переделкой из Каупин.

Вторая, менее вероятная версия — от карельского слова «kauppi» (купец, торговец) с добавлением уменьшительного суффикса -ина. В таком случае фамилия буквально означала бы «маленький торговец» или «сын торговца».

География фамилии Каупина — почти исключительно Республика Карелия и прилегающие районы Ленинградской области. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: предки были, скорее всего, карельскими крестьянами или мелкими торговцами, которые занимались обменом товаров — рыбы, пушнины, леса. Фамилия не дворянская и не купеческая в российском понимании, а именно народная, возникшая в среде карельского населения, которое в XIX веке стало получать фамилии по прозвищам.

Интересно, что в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые массово давались русским крестьянам, карельские фамилии на -ин часто сохраняли прямую связь с занятием предка. Каупина — один из таких случаев, где прозвище не затерлось до абстрактной формы, а осталось прозрачным для носителя языка.