Фамилия Каябардина — редкий случай, когда географическая привязка оказывается почти наверняка точнее любого лингвистического разбора. Скорее всего, перед нами не русская, а тюркская фамилия, закрепившаяся на северо-западе России. Основа «Каябард-» прямо указывает на село Каябарда в Республике Коми (Усть-Куломский район). Житель этого села мог получить прозвище или фамилию по месту жительства — Каябардин, а его жена или дочь — Каябардина. Такая модель, когда фамилия повторяет название деревни, типична для Севера и Приуралья, где родовые прозвища долго заменяли официальные фамилии.

Если отбросить географию и разбирать корни, слово «Каябарда» само по себе не имеет ясного значения в русском языке. Вероятнее всего, это местный топоним коми-зырянского или, возможно, более древнего финно-угорского происхождения. В коми языке «кая» может означать «восходящий» или быть частью сложного слова, а «барда» — «борода» (заимствование из русского) или, в другом контексте, «место у реки». Но это только догадки: точной этимологии названия села в открытых источниках нет.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Каябардин, то есть «человек из семьи Каябардина» или «житель Каябарды». Окончание -а в женском роде (Каябардина) — стандартная русская грамматическая форма, которая не меняет смысла фамилии. В современных списках фамилия встречается именно с таким окончанием у женщин, что говорит о её закреплении в русской паспортной системе.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Каябардина — почти наверняка потомки крестьян или охотников-промысловиков из глухих районов Коми. В XIX веке фамилии здесь часто давали по названию деревни, и до середины XX века многие жители окрестных сел носили одинаковые «топонимические» фамилии, различаясь только отчествами. Поэтому Каябардины — это не одна родовая линия, а, вероятно, несколько семей, объединённых общим местом происхождения.

Других версий, например, от личного имени или профессии, для этой фамилии нет — они были бы натяжкой. Встречается она редко, и её главная ценность для носителя — почти документальная связь с конкретным уголком на карте России.