Фамилия Кайбушева — женская форма фамилии Кайбушев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. В основе фамилии лежит тюркское имя или прозвище Кайбуш. Это имя составное: первая часть «кай» в тюркских языках может означать «скала», «твёрдый», а вторая часть «буш» — «сильный», «могучий», либо восходит к имени Буш (сокращённая форма от Абу-Бакр). Таким образом, Кайбуш — это человек, которого характеризовали как «крепкого» или «сильного как скала».

Фамилия образована по стандартной русской модели присоединением патронимического суффикса -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих согласных). Суффикс указывает на принадлежность: Кайбушев — сын Кайбуша. Такая модель массово закрепилась в XVI–XVII веках, когда русские фамилии формировались у служилых людей, в том числе у выходцев из тюркской среды. Переход имени в фамилию часто происходил через поколение: деда звали Кайбуш, его сына — Кайбушев, а внук уже получал фамилию по отцу.

Географически фамилия Кайбушева встречается в Поволжье и на Урале, особенно в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области. Это объяснимо: регион исторически был зоной активного взаимодействия русского и тюркского населения. Носители фамилии могли быть как крещёными татарами, принявшими православие и получившими фамилию по отцу, так и русскими, чьи предки носили тюркское прозвище. В отличие от многих русских фамилий на -ов, здесь нет привязки к конкретному ремеслу или географическому названию — только к личному имени.

Редкая особенность фамилии — сохранение мягкого произношения основы. В русском языке суффикс -ев обычно пишется после мягких согласных (как в «Кайбушев»), но в тюркских именах на «ш» это не всегда очевидно. Написание через «е» после «ш» — верный признак, что фамилия прошла адаптацию в русской письменной традиции, а не представляет собой позднюю кальку. Если бы фамилия была записана в XIX веке со слуха, её могли бы зафиксировать как «Кайбушов», но вариант с «е» закрепился, что говорит о грамотном оформлении документов при первом упоминании.