Фамилия Кажера — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, искать в ней типичные русские суффиксы -ов или -ин бесполезно. Основа фамилии не склоняется по модели притяжательного прилагательного, а значит, перед нами либо заимствованная фамилия, сохранившая исходную форму, либо фамилия, образованная от прозвища, которое и стало родовым именем без добавочных суффиксов.

Наиболее правдоподобная версия — польское или белорусское происхождение. В польском языке есть слово «każdy» (каждый), но ближе к фамилии стоит глагол «każać» — приказывать, велеть, либо «karać» — карать, наказывать. Фамилия могла возникнуть как прозвище строгого, властного человека — того, кто «каже» (приказывает) или «кара». В белорусском языке «кажара» может быть диалектным вариантом слова «кажан» (летучая мышь), хотя это менее вероятно для прозвища. Есть и литовский след: в литовском «kažėti» означает «жалеть, скупиться», а «kažeras» — скупой. Балтийское влияние на пограничных территориях (современные Гродненская, Витебская области) даёт немало фамилий с похожим звучанием.

Словообразовательная модель проста: основа «Кажер-» без дополнительных суффиксов. Это характерно для так называемых «неоформленных» фамилий, которые бытуют в западных регионах бывшей Речи Посполитой. Если бы фамилия была русской, она скорее выглядела бы как Кажеров или Кажерский. Отсутствие суффикса — важная улика, указывающая на польско-литовский ареал.

Географически фамилия Кажера встречается в основном в Беларуси и восточной Польше, единично — на Украине. В России она редка и, скорее всего, занесена переселенцами с запада в XIX–XX веках. Сословного барьера у такой фамилии не было: её мог носить и крестьянин, и шляхтич (мелкая польская шляхта часто сохраняла прозвища без дворянских приставок).

Сравнение с однокоренными фамилиями: Кажан, Кажанов, Кажарский, Кажевский. Все они родственны по корню «каж-», но разошлись в суффиксах и регионах. Кажера стоит особняком — это не патроним (по отцу) и не топоним (по месту), а прямое прозвище, закреплённое за родом.