Фамилию Кендюренко стоит разбирать, отталкиваясь от суффикса: перед нами типичная украинская модель на -енко. Этот суффикс в XVI–XVIII веках обозначал «маленького», «сына» или «потомка» того, кто назван в корне. То есть Кендюренко — буквально «сын Кендюра» или «потомок Кендюра». Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, где формант -енко особенно распространён, а также к югу России, куда носители могли переселиться в ходе аграрных миграций XIX века.

Корень «Кендюр» — неочевидный и редкий. Вероятнее всего, это вариант прозвища или имени Кендюра, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому слову «кендир» (конопля). В южнорусских и украинских говорах «кендюрь» или «кендюр» могли называть человека, занимавшегося выращиванием или обработкой конопли — важного для крестьянского хозяйства сырья (из него делали верёвки, ткани, масло). Такое прозвище давали либо коноплеводу, либо человеку, который торговал коноплёй. Альтернативная, но менее обоснованная версия — связь с греческим именем Кендюрос или с диалектным «кендюх» (желудок, живот), но она слаба из-за отсутствия подтверждений в документах и словарях фамилий.

Фамилия Кендюренко не относится к числу аристократических: её носителями были в основном крестьяне и казаки. В реестрах запорожского казачества и переписях Полтавщины встречаются похожие фамилии (Кендюх, Кендюшко), что подтверждает народное, ремесленное происхождение. Поскольку фамилия редкая, её географическая привязка достаточно узкая — чаще всего её можно встретить в Черкасской, Полтавской и Кировоградской областях, а также в Краснодарском крае, куда переселялись украинцы.

Написание «Кендюренко» с мягким знаком — единственно верное, хотя в метрических книгах XIX века могли фиксировать варианты «Кендуренко» или «Кендюренко» через «и» — это объясняется неграмотностью писарей и отсутствием единой орфографии. С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду однокоренных: Кендюра, Кендюх, Кендюшко, и все они указывают на одно и то же прозвище по занятию. Так что предки современного Кендюренко с высокой долей вероятности были людьми, связанными с конопляным промыслом — от поля до прядильни.