Фамилия Кендюк — один из тех случаев, когда написание вводит в заблуждение. На слух она звучит как украинская или польская, но её корень почти наверняка тюркский. Суффикс -юк в украинской ономастике типичен для фамилий, образованных от личных имён или прозвищ (как Дмитрюк, Иванюк). Однако основа «Кенд-» не объясняется из славянских языков.

Самая правдоподобная версия — от тюркского имени или прозвища «Кенде»/«Кенди». В тюркских языках (особенно крымскотатарском, турецком, ногайском) слово «кенди» (kendi) означает «свой, собственный», а также «сам». Прозвище Кенди могло закрепиться за человеком самостоятельным, своенравным или, напротив, за «своим», «родным» в общине. Менее вероятна, но возможна связь с «кендырь» — так в южных степях называли растение кендырь (сходное с коноплёй), из которого вили верёвки. Тогда прозвище Кендырь мог получить мастер по плетению, а фамилия Кендюк — его уменьшительная форма.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским областям — Волыни, Ровенщине, Хмельниччине, а также встречается в Беларуси. Это объяснимо: именно через эти земли проходили пути расселения тюркских народов (например, крымских татар, которых селили на Волыни в XV–XVII веках), и их прозвища встраивались в местную славянскую модель образования фамилий.

Словообразовательная модель проста: тюркская основа Кенд- + украинский патронимический суффикс -юк (указывающий на потомка: «сын Кендя»). То есть Кендюк — это буквально «сын Кендя» или «потомок того, кого звали Кендь/Кенда». Ударение, судя по распространённости, падает на последний слог — Кендю́к.

Среди однокоренных — фамилии Кендюхов, Кендзерский, но они уже имеют другую суффиксацию. Кендюк стоит особняком: редкий случай, когда тюркское прозвище попало в украинскую форму без переосмысления и не превратилось в Кендюков. Это говорит о том, что предок носителя был, скорее всего, не дворянином (которые часто русифицировали фамилии на -ов), а казаком, мещанином или крестьянином, и фамилия закрепилась в устной форме, какой её записал местный писарь.